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2014年多模態(tài)神經(jīng)影像與腦連接組學(xué)專題培訓(xùn)班

發(fā)布時(shí)間:2014-05-05瀏覽數(shù):2947

主辦單位:北京師范大學(xué)認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

1. 培訓(xùn)簡(jiǎn)介

近年來,人腦連接組學(xué)已成為了當(dāng)前國(guó)際神經(jīng)科學(xué)領(lǐng)域最受關(guān)注的研究熱點(diǎn)和前沿方向之一。201212月底出版的美國(guó)《科學(xué)》雜志將人腦連接組學(xué)列為2013年最為值得關(guān)注的6大科學(xué)領(lǐng)域之一。在人腦連接組學(xué)的基礎(chǔ)上,奧巴馬政府于近期提出了宏偉龐大的“腦活動(dòng)繪圖”計(jì)劃,旨在進(jìn)一步揭示神經(jīng)元細(xì)胞及其環(huán)路的結(jié)構(gòu)與功能。 

目前,針對(duì)活體人腦的連接組學(xué)研究主要采用不同模態(tài)的神經(jīng)成像技術(shù)(如腦電、腦磁、結(jié)構(gòu)、功能和擴(kuò)散磁共振成像以及近紅外光學(xué)成像等)。 基于這些神經(jīng)影像技術(shù)的海量數(shù)據(jù)可用于提取活體人腦的全腦結(jié)構(gòu)與功能連接模式,圖論方法則可進(jìn)一步用于揭示這些腦網(wǎng)絡(luò)的組織形式及其拓?fù)湫再|(zhì)。這種計(jì)算與分析框架可用于發(fā)育、老化及神經(jīng)精神疾?。ㄈ绨柶澓D『途穹至寻Y等)的研究,能夠從系統(tǒng)的角度揭示人腦的工作機(jī)制以及腦疾病發(fā)生、發(fā)展的病理機(jī)制,更可能為疾病的早期診斷和治療評(píng)價(jià)提供新的影像學(xué)標(biāo)記。由此可見,基于多模態(tài)神經(jīng)影像的人腦連接組研究具備巨大的科研價(jià)值和應(yīng)用潛力。但值得注意的是,該類研究屬于典型的交叉學(xué)科,需要研究者具備多個(gè)學(xué)科的基礎(chǔ)背景知識(shí),其具體實(shí)現(xiàn)則涉及諸多計(jì)算步驟,過程相對(duì)繁瑣,為部分研究者開展相關(guān)工作造成了一定困擾。

針對(duì)這一現(xiàn)狀,北京師范大學(xué)認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室特別開設(shè)“多模態(tài)神經(jīng)影像與腦連接組學(xué)專題培訓(xùn)班”,課程時(shí)間為5月23日- 5月25日。本次培訓(xùn)班將立足于多模態(tài)神經(jīng)影像技術(shù),重點(diǎn)講授針對(duì)人腦連接組學(xué)的方法學(xué)研究及其臨床應(yīng)用。培訓(xùn)班授課導(dǎo)師均為當(dāng)前國(guó)際復(fù)雜腦網(wǎng)絡(luò)研究領(lǐng)域的一流專家授課內(nèi)容涵蓋從最基礎(chǔ)的磁共振成像原理、影像采集、數(shù)據(jù)處理到腦網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建和分析方法以及這些研究方法在認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)和腦疾病的應(yīng)用研究。課程中,我們將安排充足的研討答疑時(shí)間以便學(xué)員和導(dǎo)師交流互動(dòng),助教人員也會(huì)進(jìn)行分步式的實(shí)習(xí)操作指導(dǎo),力求為學(xué)員做出高水平的研究工作提供切實(shí)幫助。

此次培訓(xùn)面向高校、科研院所和醫(yī)院從事神經(jīng)影像、認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)和臨床研究的相關(guān)人員,相信大家一定會(huì)獲益匪淺。

誠(chéng)摯歡迎您的參與,期盼在北京師范大學(xué)與您相聚!

 (最新消息請(qǐng)隨時(shí)關(guān)注實(shí)驗(yàn)室網(wǎng)站的相關(guān)通知)

2.授課教師簡(jiǎn)介

賀永,博士,北京師范大學(xué)認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室及IDG/麥戈文腦科學(xué)研究院教授,博士生導(dǎo)師,國(guó)家杰出青年基金和中國(guó)青年科技獎(jiǎng)獲得者。目前兼任山東大學(xué)、首都醫(yī)科大學(xué)、天津醫(yī)科大學(xué)等國(guó)內(nèi)外10余所高校、醫(yī)院、省部級(jí)實(shí)驗(yàn)室兼職教授、專家、學(xué)術(shù)委員等。2005年在中科院自動(dòng)化研究所獲博士學(xué)位。2005年至2007年在加拿大麥基爾(McGill)大學(xué)蒙特利爾神經(jīng)學(xué)研究所從事博士后研究。2008年回國(guó)在北京師范大學(xué)認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室工作,擔(dān)任“計(jì)算神經(jīng)影像與人腦連接組”團(tuán)隊(duì)學(xué)術(shù)帶頭人(PI)。先后主持和參加科技部973課題、國(guó)家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目和基金委創(chuàng)新群體等多項(xiàng)國(guó)家和省部級(jí)課題。現(xiàn)任國(guó)際期刊《Frontiers in Human Neuroscience》(客座副編輯)、《PLoS ONE》(學(xué)術(shù)編輯),《Journal of Alzheimers Disease》(副主編)和《Brain Connectivity》編委,美國(guó)阿爾茨海默病協(xié)會(huì)、荷蘭阿爾茨海默病協(xié)會(huì)、法國(guó)國(guó)家研究署、英國(guó)哈德溫博士人道研究基金會(huì)、國(guó)家自然科學(xué)基金委、中科院百人計(jì)劃等10余個(gè)國(guó)內(nèi)外機(jī)構(gòu)的基金評(píng)審專家,以及JAMA Psychiatry, PNAS, Am J Psychiatry, Ann Neurol, Brain, J Neurosci40余個(gè)國(guó)際期刊論文評(píng)審人。在PNAS, Brain, Biol Psychiatry, J Neurosci等本領(lǐng)域主流期刊共發(fā)表SCI論文130篇,SCI總引用4000余次,H指數(shù)33。曾獲國(guó)家科技進(jìn)步獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)(2013,排名第五)。帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)開發(fā)腦網(wǎng)絡(luò)分析和可視化軟件包(Gretna, BrainNet Viewer)。主要研究領(lǐng)域?yàn)橛?jì)算神經(jīng)影像與人腦連接組學(xué)。

龔高浪,博士,國(guó)家自然科學(xué)基金委優(yōu)秀青年基金獲得者,北京師范大學(xué)認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室研究員,博士生導(dǎo)師。2006年畢業(yè)于中科院自動(dòng)化所,獲博士學(xué)位,2006-2010赴加拿大Alberta大學(xué)、Mcgill大學(xué)從事博士后研究,2011年至今在北師大認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室工作。榮獲scopus“青年科學(xué)之星”(生命領(lǐng)域),入選北京市科技新星計(jì)劃。主要從事基于結(jié)構(gòu)與彌散磁共振神經(jīng)影像的活體腦連接與腦網(wǎng)絡(luò)研究,已在本領(lǐng)域權(quán)威期刊(如Journal of Neuroscience, Cerebral Cortex, Neuroimage等 )發(fā)表SCI論文多篇,相關(guān)研究工作得到了國(guó)內(nèi)外同行的廣泛關(guān)注和高度評(píng)價(jià),發(fā)表論文已被SCI引用超過700次。已獲批軟件著作權(quán)3項(xiàng)(如PANDA軟件),發(fā)明專利1項(xiàng)。 現(xiàn)任PLoS ONE學(xué)術(shù)編輯(academic editor),國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目、中荷聯(lián)合科研主題(JSTP)項(xiàng)目評(píng)審專家,并擔(dān)任多個(gè)國(guó)際期刊審稿人,現(xiàn)承擔(dān)多項(xiàng)國(guó)家級(jí)科研項(xiàng)目(如國(guó)自然面上項(xiàng)目、科技部973(青年科學(xué)家項(xiàng)目)科研骨干、國(guó)家社科基金重大專項(xiàng)子課題等)。

牛海晶,博士,北京師范大學(xué)認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室985研究員,碩士生導(dǎo)師。20062009年在天津大學(xué)和北京師范大學(xué)分獲碩士和博士學(xué)位。20072009年在中國(guó)科學(xué)院自動(dòng)化研究所模式識(shí)別國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室做訪問學(xué)生;20092010年在美國(guó)德州大學(xué)阿靈頓分校(University of Texas at Arlington)從事博士后研究。20107月回國(guó)在北京北京師范大學(xué)認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室工作,現(xiàn)為“計(jì)算神經(jīng)影像與人腦連接組”團(tuán)隊(duì)成員。先后主持國(guó)家自然科學(xué)基金、高等學(xué)校博士學(xué)科點(diǎn)專項(xiàng)科研基金、中央高?;究蒲袠I(yè)務(wù)專項(xiàng)基金等課題。現(xiàn)為國(guó)際期刊《PLoS ONE》、《Journal of Biomedical Optics》、《Optics Express》、《Optical Engineering》的論文評(píng)審人,北京市自然科學(xué)基金以及北京市科學(xué)技術(shù)獎(jiǎng)的評(píng)委(會(huì)評(píng))成員。先后在Optics Letter, Optics Express,, Journal of Biomedical Optics以及PLoS ONE等本領(lǐng)域期刊發(fā)表SCI論文10余篇,獲國(guó)家發(fā)明專利一項(xiàng)。主要研究領(lǐng)域?yàn)榛诠δ芙t外光譜成像(fNIRS)的人腦連接組方法學(xué)及應(yīng)用研究。

朱禮濤,博士,北京師范大學(xué)認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室磁共振成像工程師。1999年畢業(yè)于山東大學(xué)數(shù)學(xué)與系統(tǒng)科學(xué)學(xué)院,獲得理科學(xué)士學(xué)位;2004年畢業(yè)于中國(guó)科學(xué)院自動(dòng)化研究所,獲得工科博士學(xué)位,研究方向?yàn)獒t(yī)學(xué)圖像處理。畢業(yè)后進(jìn)入磁共振生產(chǎn)廠家公司從事脈沖序列設(shè)計(jì)和成像質(zhì)量改進(jìn)方面的研發(fā)工作;其后調(diào)入北京師范大學(xué)認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,擔(dān)任腦成像中心磁共振成像系統(tǒng)工程師,參與腦成像中心的建設(shè),負(fù)責(zé)磁共振設(shè)備的成像質(zhì)量保證、成像技術(shù)及其應(yīng)用等方面的研發(fā)工作。

廖旭紅,博士,杭州師范大學(xué)認(rèn)知與腦疾病研究中心副研究員。20117月于北京師范大學(xué)物理系獲得理論物理博士學(xué)位,研究方向?yàn)閺?fù)雜系統(tǒng)與非線性動(dòng)力學(xué),主要從事復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)上的自持續(xù)振蕩的機(jī)制與控制研究。20119月起在杭州師范大學(xué)認(rèn)知與腦疾病研究中心工作,現(xiàn)主持一項(xiàng)國(guó)家自然科學(xué)青年基金課題。研究領(lǐng)域?yàn)?/span>靜息態(tài)功能磁共振計(jì)算方法學(xué)及應(yīng)用研究,主要結(jié)合圖論與靜息態(tài)功能磁共振成像技術(shù)研究腦功能網(wǎng)絡(luò)的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)、動(dòng)力學(xué)特性及相關(guān)生理機(jī)制。在NeuroImage等國(guó)際期刊發(fā)表SCI論文多篇。

夏明睿博士,北京師范大學(xué)認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室助理研究員。2013 年獲北京師范大學(xué)認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室博士學(xué)位。主要從事于基于多模態(tài)神經(jīng)影像的結(jié)構(gòu)和功能復(fù)雜腦網(wǎng)絡(luò)計(jì)算方法、軟件開發(fā)及其在阿爾茨海默病中的應(yīng)用研究。 最近三年在本領(lǐng)域國(guó)際期刊(如Brain Struct Func; J Alzheimers Dis; PLoS One等)已發(fā)表(含接受)SCI論文15篇。開發(fā)的腦網(wǎng)絡(luò)可視化軟件BrainNet Viewer軟件下載量達(dá)6000余次,已被發(fā)表在國(guó)際頂級(jí)期刊NeuronPNAS等的120余篇高水平文章引用。曾獲2012年度教育部博士研究生學(xué)術(shù)新人獎(jiǎng)。

崔再續(xù),北京師范大學(xué)認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室博士研究生。曾獲2013年度認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室優(yōu)秀學(xué)術(shù)成果獎(jiǎng)一等獎(jiǎng)、2013年度碩士生國(guó)家獎(jiǎng)學(xué)金、2014年度特等博士生優(yōu)秀新生獎(jiǎng)。研究方向?yàn)槟J椒诸愒谀X影像領(lǐng)域的應(yīng)用。編寫了擴(kuò)散磁共振并行數(shù)據(jù)處理分析軟件PANDA,下載量已達(dá)到6800余次,在研究中使用到我們的軟件進(jìn)行dMRI數(shù)據(jù)處理的工作發(fā)表的雜志包括Brain, Radiology等。

王鑫迪北京師范大學(xué)認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室博士研究生。研究興趣為靜息態(tài)功能磁共振預(yù)處理與信號(hào)分析,參與REST維護(hù)工作。GRETNA、CCS、DPABI(即將發(fā)布)主要開發(fā)人員。2013年于芬蘭交流期間主要負(fù)責(zé)MREG基于GPU的快速重建工作。

3. 課程安排

點(diǎn):北京師范大學(xué)腦成像中心會(huì)議室(北京師范大學(xué)科技樓北側(cè)紅樓)(具體上課地點(diǎn)以注冊(cè)時(shí)通知為準(zhǔn),最新消息請(qǐng)關(guān)注實(shí)驗(yàn)室網(wǎng)站)

實(shí)習(xí)操作準(zhǔn)備:請(qǐng)自行攜帶筆記本電腦,要求Microsoft Windows 系統(tǒng)、2G以上內(nèi)存,10G以上剩余磁盤空間,并安裝常用軟件Matlab、MRIcro、MRIcroN等。DTI數(shù)據(jù)并行處理軟件PANDA需要再Linux環(huán)境下運(yùn)行,有一定基礎(chǔ)的學(xué)員可以預(yù)裝Linux系統(tǒng)以及Linux版本的Matlab。我們也會(huì)在注冊(cè)時(shí)幫助學(xué)員配置系統(tǒng)環(huán)境,安裝軟件。授課所用軟件學(xué)員需提前下載最新版本,地址為:

 

BrainNet Viewer : http://www.nitrc.org/projects/bnv/

PANDAhttp://www.nitrc.org/projects/panda/

Gretna: http://www.nitrc.org/projects/gretna/

 

課程設(shè)置:

時(shí) 

授課內(nèi)容

授課人員

522

14:00-17:00

注冊(cè)、領(lǐng)取材料,預(yù)裝教學(xué)軟件,請(qǐng)攜帶個(gè)人電腦。地點(diǎn):腦成像中心一樓大廳

523

8:30-9:25

人腦連接組學(xué)研究概況

  

9:25-10:20

圖論基礎(chǔ)知識(shí)I

廖旭紅

10:20-10:35

茶歇

10:35-11:30

圖論基礎(chǔ)知識(shí)II

廖旭紅

中午

午餐

 

14:00-15:00

磁共振成像基本原理、數(shù)據(jù)采集及注意事項(xiàng)

朱禮濤

15:00-15:15

茶歇

15:15-16:15

腦連接組可視化軟件Brainnet Viewer詳解

夏明睿

16:15-17:15

腦連接組可視化軟件Brainnet Viewer實(shí)例

夏明睿/助教(6-8人)

19:00-21:00

腦連接組可視化軟件Brainnet Viewer上機(jī)操作答疑

夏明睿/助教(6-8人)

524

8:30-9:25

基于FMRI的腦功能連接組學(xué)計(jì)算方法

  

9:25-10:20

基于FMRI的腦功能連接組學(xué)應(yīng)用研究

  

10:20-10:35

茶歇

10:35-11:30

基于fNIRS的腦功能連接組學(xué)計(jì)算方法及應(yīng)用

牛海晶

中午

午餐

14:00-15:00

腦功能連接組分析軟件Gretna詳解(I

王鑫迪

15:00-16:00

腦功能連接組分析軟件Gretna詳解(II

王鑫迪

16:00-16:15

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